Metanogenele sunt strict anaerobe si produc gaz metan ca produs final al fermentatiei (reduc CO2 la CH4 in absența O2: 4H4+CO2 > CH4+2H2O). Ele sunt prezente in nămolul de pe fundul unor ape stătătoare, in stomacul animaleleor (in sepecial al rumegătoarelor), fiind responsabile pentru gazul de mlaștină, eliminarea de gaz metan (flatulența la oameni). In sedimente marine productia biologica de metan, denumită de asemenea metanogeneza, este in general limitată la cazurile in care există o deficiență de sulfați, sub straturile superioare.
Pană nu demult se credea că rolul lor ca producători in ecosisteme este neglijabil. Populațiile Archaea metanogene joacă un rol indispensabil in epurarea apelor reziduale anaerobe. Alte metanogene sunt extremofile, regăsind-se in medii cum ar fi izvoare termale și hidrotermale submarine precum și in roca "solidă" din scoarța Pămantului, la kilometri de suprafata.
Archaea sulf-dependente trăiesc in medii termofile și reduc sulful elementar sau oxidează compușii sulfului pentru a obține energie sub forma potențialului reducător. Sunt specii aerobe și anaerobe.
Halofilele trăiesc in medii hipersaline și unele se protejează de lumină cu un pigment care conține carotenoizi. Sunt aerobe obligate. Organismele obișnuite nu pot trăi in medii foarte sărate, insă halofilele pot datorită unor adaptări fiziologice ce le permit să rețină apa.